Нормальная микрофлора влагалища преимущественно состоит из палочек Додерляйна (молочные бактерии). Они должны определяться в мазке вместе с эпителиальными клетками (поверхностный слущивающийся слой стенок влагалища) и небольшим количеством лейкоцитов (до 20 в поле зрения микроскопа).

Другие микроорганизмы, в норме живущие во влагалище (грибки, гарднереллы), присутствуют в небольших количествах, не позволяющих увидеть их в мазке.

Лейкоциты - защитные клетки, борющиеся с возбудителями инфекции. Их количество повышается при воспалительных заболеваниях, они являются признаком наличия инфекции, но не позволяют определить конкретного возбудителя.

У здоровой женщины влагалищный секрет имеет слабокислую реакцию, так как содержит 0,5% молочной кислоты. Как и все полости, сообщающиеся с поверхностью тела, влагалище содержит очень разнообразную бактерийную флору. Тут можно только указать, что при наиболее благоприятных физиологических условиях флора влагалища почти исключительно состоит из палочковой флоры - лактобацил. Однако необходимо отметить, что и у совершенно здоровых женщин во влагалище очень часто можно найти чрезвычайно различную по своим формам бактерийную флору, причём среди этих бактерий встречаются иной раз и резко патогенные (болезнетворные).

Цитолитический вагиноз в последнее время все чаще стал беспокоить женщин в связи с избыточным использованием средств интимной гигиены с кислым рН, а также применения средств  с содержанием лактобактерий (ацилакт итп).